 Fabian Peter Hammerle
|
863bbde9ed
set upper version constraint for dependencies to prevent unexpected breaking changes
|
6 ani în urmă |
 Fabian Peter Hammerle
|
88a2a730e0
script: added param --source-types to optionally enable collection of ASHS volumes files
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
8df9dbc392
fix failing coverage check due to pandas.concat() version branch
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
1d0891eced
Merge branch 'master' into ashs-script
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
bd4f82e4bb
travis-ci: require test coverage of 100%
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
2118f68b20
refactor main: lambda find_volume_files
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
a7044df8ae
readme: fix --source-types arg
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
6b2c883982
coverage: enable branch management
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
0a098ce5d1
travis-ci: fail if coverage < 100%
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
0d6cacdd34
Revert "configure pytest to always create coverage report"
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
a581e5aad7
test abstract VolumeFile.* to increase coverage
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
d69fc4ae7b
fix pylint ignore unexpected-keyword-arg instruction (pandas<0.23)
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
1abafc1ed8
test `python -m` module call to increase coverage
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
3af0d701e7
setup.py: added missing pytest-cov dependency
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
3f6dc3ba53
configure pytest to always create coverage report
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
43f43f806c
git ignore coverage data
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
88ea8b6f10
adapt ASHS bert dummy test data to fix tests failing inadvertently due different order of rows in frame
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
6f0484ee66
ignore pylint unexpected-keyword-arg for pandas<0.23
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
b667c9bd79
travis-ci: configure pytest to create coverage report
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
8bf88df3f6
test data: round volumes in subjects/all-hippocampal-volumes.csv to match precision in other csv files
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
c6ed274451
adapt ASHS bert dummy test data to fix tests failing inadvertently due different order of rows in frame
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
0bd50096fc
rename source type: `freesurfer` -> `freesurfer-hipposf`
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
65e9d507cd
adapt ASHS dummy test data to fix tests failing inadvertently due different order of rows in frame
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
2c7299438e
integration test against specifying both --ashs-filename-regex & --freesurfer-filename-regex
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
bf7feb5ba0
restore compatibility with pandas<0.23
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
526f05c29c
readme: fixed link list formatting
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
189dd5303c
script: added param --source-types to optionally enable collection of ASHS volumes files; added column `source_type`
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
f7b5c8b5f1
move remove_group_names_from_regex() to __init__.py
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
7ca94fde34
Merge branch 'ashs' of github.com:fphammerle/freesurfer-volume-reader
|
6 ani în urmă |
|
Fabian Peter Hammerle
|
0635281aa4
refactor examples/barplot.py
|
6 ani în urmă |
