fphammerle/freesurfer-surface @ 3e76db629b3aa185d82ab845ba98bd73c97376af

Bez popisu

3 Větve

Fabian Peter Hammerle 3e76db629b fix _PolygonalCircuit.__eq__()		před 5 roky
examples	253ca9024e Annotation: replaced attribute `vertex_{color_codes->label_index}`; changed type of attribute `labels` to dict	před 5 roky
freesurfer_surface	3e76db629b fix _PolygonalCircuit.__eq__()	před 5 roky
tests	3e76db629b fix _PolygonalCircuit.__eq__()	před 5 roky
.gitignore	0303eb775c added Surface.read_triangular(), setup.py & dev pipenv	před 5 roky
Pipfile	24189db123 pipenv: added autopep8 to dev deps	před 5 roky
Pipfile.lock	24189db123 pipenv: added autopep8 to dev deps	před 5 roky
README.md	069514eb23 readme: added python example on how to list labels	před 5 roky
setup.py	c9481a48cd Label: fixed color codes; added property hex_color_code; added script freesurfer-annotation-labels	před 5 roky

Usage

List Labels in Annotation File

from freesurfer_surface import Annotation

annotation = Annotation.read('tests/subjects/fabian/label/lh.aparc.annot')
for label in annotation.labels.values():
    print(label.index, label.hex_color_code, label.name)

$ freesurfer-annotation-labels tests/subjects/fabian/label/lh.aparc.annot
index	color	name
0	#190519	unknown
1	#196428	bankssts
2	#7d64a0	caudalanteriorcingulate
3	#641900	caudalmiddlefrontal
...
33	#4614aa	temporalpole
34	#9696c8	transversetemporal
35	#ffc020	insula

README.md

Usage

List Labels in Annotation File